Способность инактивировать практически любой ген в ЭСК путем

Суббота, 17 Март, 2012

Способность инактивировать практически любой ген в ЭСК путем использования генов – мишеней очень улучшило понимание ролей специфических генов на клеточном и организменном уровне. Более того, ЭСК и клетки эмбриональной карциномы использовались широко для исследования того, как запускается и прекращается работа специфических генов в течение дифференцировки. В этой связи ДНК array технология использовалась для идентификации генов, регулируемых, когда ЭСК дифференцируются/35/. ЭСК имеют способность самообновляться и дифференцироваться в клеточные дериваты эндодермальной, эктодермальнй и мезодермальной линий. ЭСК были использованы для анализа эффектов экзогенных факторов на путь развития в течение дифференцировки in vitro. При использовании подхода потери функции in vitro, основанном на дефицитных по бета1 интегрину ЭСК, было обнаружено, что интегрин-зависимые механизмы участвуют в экспрессии Wnt-1 и BMP-4. Антагонистические эффекты сигнальных молекул Wnt-1 and BMP-4, морфогенов участвующих в ранних событиях дифференцировки, изучались in vivo и in vitro: Wnt-1 действует как действенный индуктор мезодермы, в то время как BMP-4 играет критическую роль в детерминации нейроэктодермы. Взаимодействие клеток с экстрацеллюлярным матриксом через детрминанты интегринов определяет экспрессию сигнальных молекул BMP-4 and Wnt-1, в результате чего происходит активация мезодермальной и нейроэктодермальной линий соотвественно. Результаты подтверждают идею, что влияние экстрацеллюлярной “ниши” на судьбу развития плюрипотентных стволовых клеток определяется не только растворимыми факторами, но также экстрацеллюлярным матриксом/8/. Развитие плана тела контролируется большой сетью регуляторных генов.

Рассматриваются данные о регуляторной сети генов, которая контролирует спецификацию эндодермы и мезодермы у эмбриона морского ежа. Сеть была создана на основании крупномасштабного пертурбационного анализа, в комбинации с компьютерными методологиями, данными геномики, cis-регуляторным анализом и молекулярной эмбриологией. Сеть содержит более 40 генов на настоящий момент, и каждое затруднение может быть прямо проверено на уровне последовательности ДНК cis-регуляторным анализом. Ее архитектура выявляет специфические и общие аспекты развития, такие, как данные клетки определяют их предопределенную судьбу в эмбрионе и почему процесс идет вперед во время развития/9/. Относительный состав оснований ДНК регуляторных последовательностей недетерминированных полипотентных родоначальных клеток может иметь значение для частоты транскрипции этих генов при клеточной дифференцировке. Последовательности этих регуляторных областей генов клеточной детерминации, которые обогащены А-Т, создают потенциал для транскрипции из-за их более низко температуры плавления и склонности к связыванию. Одна или несколько групп высокой мобильности хроматиновых белков преимущественно связываются с богатыми АТ регуляторными последовательностями, что приводит к увеличению уровня транскрипции. Нефосфорилированные гистоны, реагирующие с теми же регуляторными сайтами, могут увеличивать частоту транскрипции. Уровень клеточного роста, т. е. суммарный белковый синтез клетки позитивно коррелирует с синтезом белков хроматина высокой мобильности.

Способность инактивировать практически любой ген в ЭСК путем

Ссылки на hydra2web,com,de